Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scara5Q8K299 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scara5Q8K299 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms