Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms