Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Nek9Q8K1R7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nek9Q8K1R7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nek9Q8K1R7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Nek9Q8K1R7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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