Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgbQ8K0E8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FgbQ8K0E8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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FgbQ8K0E8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgbQ8K0E8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms