Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp1Q8K021 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp1Q8K021 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms