Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trip10Q8CJ53 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trip10Q8CJ53 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms