Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ep400Q8CHI8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms