Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setd1bQ8CFT2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Setd1bQ8CFT2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Setd1bQ8CFT2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms