Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms