Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef8Q8CE24 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Pramef8Q8CE24 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef8Q8CE24 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms