Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc9Q8CDN9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms