Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RybpQ8CCI5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms