Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms