Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms