Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9X1

Sntn, Sentan, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SntnQ8C9X1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SntnQ8C9X1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SntnQ8C9X1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms