Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
A430089I19RikQ8C9W1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms