Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Atg4aQ8C9S8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Atg4aQ8C9S8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Atg4aQ8C9S8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Atg4aQ8C9S8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Atg4aQ8C9S8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Atg4aQ8C9S8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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