Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dclre1bQ8C7W7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dclre1bQ8C7W7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms