Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp47Q8BY87 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms