Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms