Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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