Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn17Q8BXA6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn17Q8BXA6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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