Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms