Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubr7Q8BU04 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubr7Q8BU04 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms