Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q8BPC6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms