Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem260Q8BMD6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms