Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zcchc4Q8BKW4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms