Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tspan9Q8BJU2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan9Q8BJU2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms