Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup107Q8BH74 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup107Q8BH74 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms