Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms