Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Amigo1Q80ZD8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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