Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ttc28Q80XJ3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc28Q80XJ3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc28Q80XJ3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc28Q80XJ3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc28Q80XJ3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc28Q80XJ3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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