Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pcsk9Q80W65 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pcsk9Q80W65 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pcsk9Q80W65 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pcsk9Q80W65 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pcsk9Q80W65 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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