Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sestd1Q80UK0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms