Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Avl9Q80U56 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms