Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atf7ipQ7TT18 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf7ipQ7TT18 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms