Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Uhrf2Q7TMI3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Uhrf2Q7TMI3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf2Q7TMI3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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