Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ino80Q6ZPV2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms