Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms