Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrt3Q6PE13 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms