Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RgmaQ6PCX7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms