Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Herc4Q6PAV2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms