Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms