Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf728Q6P5C7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Znf728Q6P5C7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Znf728Q6P5C7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Znf728Q6P5C7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Znf728Q6P5C7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Znf728Q6P5C7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms