Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg2aQ6P4T0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms