Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Frg2f1Q6P3A2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms