Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms