Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd2Q6NXI6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms