Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms