Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CltbQ6IRU5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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CltbQ6IRU5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CltbQ6IRU5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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